La asignatura de Botánica Sistemática se imparte a estudiantes del III ciclo de Ciencias Agrarias, que lograron adquirir sólidos conocimientos de Botánica General, que les permita comprender eficazmente los fundamentos de origen, identificación, clasificación, diversidad y estructura de las plantas que se cultivan en los trópicos.

Además, proporcionará el estudio de las diferentes categorías botánicas, particularmente de la flora nativa de nuestro territorio peruano y la Región San Martín. El curso, inculca a orientar y familiarizar al estudiante de Ciencias Agrarias, hacia la valorización actual y potencial de nuestros recursos naturales, motivando la investigación y difusión de aquellas especies vegetales de importancia agrícola, agroindustrial, apícola, farmacológica y ornamental.